सिस-ट्रांस पूरकता परीक्षण का उपयोग यह निर्धारित करने के लिए किया जाता है:

1
यदि दो उत्परिवर्तन ऐलीलिक प्रकृति के हों
2
यदि दो जीन एक दूसरे के साथ परस्पर क्रिया करते हैं
3
फेनोटाइप को प्रभावित करने वाले जीनों की संख्या
4
एलील्स के साथ प्रभावी/अप्रभावी संबंधों को समझना

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